內設機構：
市委農辦秘書處，辦公室、人事處、法規處、政策與改革處(發展規劃處)、計劃處、財務處、鄉村文化與產業融合發展促進處、鄉村建設處、農村社會事業促進處(縣域經濟發展處)、農村合作經濟指導處、幫扶與督查處、市場信息與對外合作處、科技教育處(市農業轉基因生物安全管理辦公室)、農業資源保護與利用處、農產品質量安全監管處、種植業管理處(農藥管理處)、畜牧處、動物防疫處、漁業漁政管理處、種業管理處、農業機械化管理處、農田建設管理處、行政審批和政務服務處、農業農村信息化處、鄉村產業發展處(農產品加工指導處)，另設機關黨委、離退休人員管理服務處。
主要職能
(一)統籌研究和組織實施“三農”工作的發展中長期規劃、重大政策。組織起草農業農村有關地方性法規和市政府規章草案，指導全市農業綜合執法。參與涉農的價格、收儲、金融保險、進出口等政策制定。
(二)統籌推動發展農村社會事業、農村公共服務、農村文化、農村基礎設施和鄉村治理。牽頭組織改善農村人居環境。指導農村精神文明建設和優秀農耕文化建設。
(三)研究提出深化農村經濟體制改革和鞏固完善農村基本經營制度的政策建議。負責農民承包地、農村宅基地改革和管理有關工作。負責農村集體產權制度改革，指導農村集體經濟組織發展和集體資產管理工作。指導農民合作經濟組織、農業社會化服務體系和新型農業經營主體建設與發展。
(四)統籌全市扶貧開發和對外扶貧協作工作。起草扶貧開發、對外扶貧協作的相關政策、規劃并組織實施。負責精準扶貧工作督查考核評估，指導推動專項扶貧、行業扶貧和社會扶貧。負責市內農業產業扶貧開發工作。推動實現鞏固拓展脫貧攻堅成果同鄉村振興有效銜接。
(五)指導鄉村特色產業、農產品加工業、休閑農業和鄉鎮企業發展工作。提出促進大宗農產品流通的建議，培育、保護農業品牌。發布農業農村經濟信息，監測分析農業農村經濟運行。承擔農業統計和農業農村信息化有關工作。
(六)負責種植業、畜牧業、漁業、農業機械化等農業各產業的監督管理。指導糧食等農產品生產。組織構建現代農業產業體系、生產體系、經營體系，指導農業標準化生產。負責漁政漁港監督管理。
(七)負責農產品質量安全監督管理。組織開展農產品質量安全監測、追溯、風險評估，發布農產品質量安全信息。貫徹執行農產品質量安全國家標準，參與制定農產品質量安全地方標準并會同有關部門組織實施。指導農業檢驗檢測體系建設。
(八)組織農業資源區劃工作。指導農用地、漁業水域以及農業生物物種資源的保護與管理，負責水生野生動植物保護、耕地及永久基本農田質量保護工作。指導農產品產地環境管理和農業清潔生產。指導設施農業、生態循環農業、節水農業發展及農村可再生能源綜合開發利用、農業生物質產業發展。牽頭管理外來物種。
(九)負責有關農業生產資料和農業投入品的監督管理。組織農業生產資料市場體系建設，貫徹執行農業生產資料、獸藥質量、獸藥殘留限量和殘留檢測方法國家標準并監督實施。組織獸醫醫政、獸藥藥政藥檢工作，負責執業獸醫和畜禽屠宰行業管理。
(十)負責農業防災減災、農作物重大病蟲害防治工作。指導動植物防疫檢疫體系建設，組織、監督全市動植物防疫檢疫工作，發布疫情并組織撲滅。配合有關部門制定血吸蟲病防治工作計劃并組織實施。
(十一)負責農業投資管理。編制農業投資項目建設規劃，提出農業投資規模和方向、扶持農業農村發展財政項目的建議，按規定權限審批農業投資項目，負責農業投資項目資金安排和監督管理。
(十二)推動農業科技體制改革和農業科技創新體系建設。指導農業產業技術體系和農技推廣體系建設，組織開展農業領域的高新技術和應用技術研究、科技成果轉化和技術推廣。負責農業轉基因生物安全監督管理和農業植物新品種保護。
(十三)指導農業農村人才工作。擬訂農業農村人才隊伍建設規劃并組織實施，指導農業教育和農業職業技能開發，指導新型職業農民培育、農業科技人才培養和農村實用人才培訓工作。
(十四)組織參與農業對外合作工作。承辦有關農業涉外事務，組織開展農業貿易促進和有關對外交流合作，具體執行有關農業援外項目。
(十五)負責對全市農業機械、畜牧業和漁業生產、農田水利建設等農業領域安全監督管理。
(十六)完成市委、市政府和市委農村工作領導小組交辦的其他任務。
(十七)職能轉變。
1.統籌實施鄉村振興戰略，深化農業供給側結構性改革，提升農業發展質量，扎實推進美麗鄉村建設，推動農業全面升級、農村全面進步、農民全面發展，加快實現農業農村現代化。
2.加強農產品質量安全和相關農業生產資料、農業投入品的監督管理，堅持最嚴謹的標準、最嚴格的監管、最嚴厲的處罰、最嚴肅的問責，嚴防、嚴管、嚴控質量安全風險，讓人民群眾吃得放心、安心。
3.深入推進簡政放權，加強對行業內交叉重復以及性質相同、用途相近的農業投資項目的統籌整合，最大限度縮小項目審批范圍，進一步下放審批權限，加強事中事后監管，切實提升支農政策效果和資金使用效益。
4.強化鞏固拓展脫貧攻堅成果等職責，全國脫貧攻堅目標任務完成后的過渡期內，鄉村振興主要職責及機構、有關幫扶政策、財政支持、項目安排保持總體穩定，資金項目相對獨立運行管理。突出鄉村振興工作職責，確保鄉村產業、人才、文化、生態、組織“五個振興”有效推進。
(十八)有關職責分工
與市市場監督管理局有關職責分工
(1)市農業農村局負責食用農產品從種植養殖環節到進入批發、零售市場或生產加工企業前的質量安全監督管理。食用農產品進入批發、零售市場或生產加工企業后，由市市場監督管理局監督管理。
(2)市農業農村局負責動植物疫病防控、畜禽屠宰環節、生鮮乳收購環節質量安全的監督管理。
(3)兩部門要建立食品安全產地準出、市場準入和追溯機制，加強協調配合和工作銜接，形成監管合力。